一般的なオンラインショッピング（B2C）は個人消費者を対象としていますが、B2B電子商取引はビジネス間の取引です。この違いにより、いくつかの実務上の違いが生じます。B2B取引は通常、注文金額が大きく、仕様の確認がより複雑で、調達サイクルが長く、同じ顧客からの繰り返し購入があります。そのため、B2B電子商取引の重点は最初の注文を完成させることだけでなく、顧客が自力で注文・再注文できるシステムを構築し、毎回最初から問い合わせする往復コストを削減することにあります。例えば、自動車部品メーカーがエンジン、燃料ポンプ、ネジなどの部品を自動車製造業者の組立用に販売する場合、最終消費者ではなく企業に販売するため、一般的な電子商取引とはまったく異なる調達ロジックが適用されます。